具体设计规则
尊龙凯时提供的合成PNA序列通常长度不超过18个碱基,接头、氨基酸和标记物不计入该长度。序列可以在N端或C端添加一个赖氨酸或半胱氨酸以增加其功能性。

嘌呤含量
PNA序列中嘌呤含量过高会影响其水溶性并导致聚合反应,因此建议将嘌呤含量限制在60%以下。如序列“GATTAGCAGTCTACG”符合该原则(嘌呤含量<60%),而“ATTAGGGGCATCTAC”由于连续出现4个G则不符合要求。此外,若连续嘌呤数超过4个或鸟嘌呤数超过3个,则该序列应视为不可行。在设计探针时,建议考虑互补链的使用,例如“GTAGATGCCCCTAAT”是合格的互补序列。
避免自我互补序列
在设计PNA探针时,应尽量避免出现反向重复、发夹和回文序列。因为PNA/PNA之间的相互作用强于PNA/DNA,这些类型的探针易发生聚合。虽然四个碱基互补是允许的,但全C和G的组合需要谨慎处理。例如,序列“GATAATTGCA”是合规的,而“GATCCGGTAC”由于仅包含CCGG则不合格。
互补基础规则
设计中应避免六个或以上的互补碱基,除非它们之间由其他碱基隔开。例如“AGTGCTACT”是合适的组合,但“GCGGCTCGC”则不被允许。即使由间隔碱基打断,8个碱基的完全互补也不被推荐,例如“ACTGTCAGT”也是不合适的,建议遵循这些准则以确保探针设计的有效性。
一般设计建议
尊龙凯时建议设计反向平行的PNA探针,这是形成最常见双链的最佳取向。PNA可以在任意方向形成双链,但反向平行的构象对于反义和DNA探针应用尤为重要。在这种情况下,PNA探针的N端与DNA的5'端相对应。
虽然PNA和DNA的熔点有所不同,由于PNA链是不带电的,其PNA-DNA的Tm值一般会高于DNA-DNA。在100mM NaCl浓度下,每增加一个碱基,Tm值的提高约为1°C。对于10个和15个碱基的PNA,Tm值大约为50°C和70°C;所以,长度在12至17个碱基的PNA序列是最优设计。需要注意的是,相比于DNA,PNA探针所需序列长度更短。
订购信息
尊龙凯时所提供的PNA价格依据序列长度、产量及纯度而定。请将具体需求发送给我们,我们将第一时间与您联系。最低订购量为未标记PNA 20nmole,标记PNA 10nmole,且可选择90%和95%的纯度。我们提供HPLC纯度分析和质谱分析报告,通常交货时间为2-3周,gamma PNA或修饰标记的交货时间为3-4周。
精选引用研究
若您想了解使用
尊龙凯时的PNA所发表的研究文献,请查看如下文章:
- Exponential Increase in an Ionic Signal: A Dominant Role of the Space Charge Effect on the Outer Surface of Nanochannels. Anal Chem | 28 Sep 2021
- Peptide Nucleic Acid-Functionalized Nanochannel Biosensor for the Highly Sensitive Detection of Tumor Exosomal MicroRNA. Anal Chem | 30 July 2021
- Ultrasensitive Exosomal MicroRNA Detection with a Supercharged DNA Framework Nanolabel. Anal Chem | 2 April 2021